Tên đề tài | Xây dựng quy trình xác định phức hợp kháng nguyên bạch cầu người (HLA) độ phân giải cao bằng phương pháp giải trình tự gen phục vụ cho nhu cầu ghép tạng |
Năm thực hiện | 2019 |
Chủ nhiệm đề tài | TS.BS. Đỗ Đức Minh - Thời gian thực hiện: 24 tháng - Thời gian NT:27/6/2019 |
Cơ quan chủ quản | Đại học Y dược Thành phố Hồ Chí Minh |
Sản phẩm | - Quy trình ứng dụng bộ kit TruSight HLA v2 để định típ HLA - Quy trình định típ HLA bằng phương pháp giải trình tự kết hợp với tạo dòng - Báo cáo chuyên đề “Các kỹ thuật sinh học phân tử dùng trong định típ HLA” - Báo cáo chuyên đề “Ứng dụng của việc định típ HLA dùng trong ghép tạng và ghép tế bào gốc” - 02 bài báo đăng tạp chí Y học - Đào tạo 01 THS |
Kết quả | Tuyển chọn và thu thập mẫu máu ngoại vi của 100 người tình nguyện để định típ HLA Tách chiết DNA từ các mẫu máu bằng bộ kit Qiagen Dnaeasy Blood kit Chuẩn bị thư viện phục vụ cho giải trình tự các gen của phức hợp HLA bằng bộ kit TruSight HLA v2 của Illumina Giải trình tự các gen phức hợp HLA bằng máy giải trình tự thế hệ mới MiniSeq Sử dụng phần mềm Assign 2.0 TruSight HLA của Illumina để phân tích kết quả giải trình tự này (đây là phần mềm có bản quyền, được bán kèm theo kit TruSight HLA v2) Khuếch đại các exon quyết định tính đa hình ở các gen của phức hợp HLA bằng PCR (exon 2,3 của HLA lớp I và exon 2 của HLA lớp II) Giải trình tự các gen của phức hợp HLA bằng phương pháp Sanger Tạo dòng các gen này và giải trình tự lần 2 để xác định chính xác trình tự của các vùng đa hình. So sánh kết quả thu được từ 2 phương pháp, viết báo cáo nghiệm thu, chuyên đề và bài báo khoa học |